Het Trésor bezit een grote collectie atlassen en kaarten uit de periode voor 1900. De digitalisering van de collectie kaarten is in 2007 en 2008 – dankzij een subsidie van de Mondriaan Stichting – goed op gang gekomen. De kern van de collectie kaarten, bestaande uit een duizendtal kaarten en losse atlasbladen is gefotografeerd en toegankelijk gemaakt via de catalogus van de bibliotheek. Deze kaarten zijn van provincies, polders, stadsplattegronden uit de 17e tot en met de 19e eeuw. Ook zijn er kaarten van voormalige Nederlandse overzeese gebieden uit de 18e en 19e eeuw. Verder bevat de collectie rivierkaarten en waterstaatskaarten. Er zijn ook enkele manuscriptkaarten aanwezig waaronder die van Justus van Broeckhuisen uit 1701. De atlassen van Joan Blaeu, Boxhornius, Braun en Hogenberg, Abraham Ortelius, Isaac Tirion en Nicolas J. Visscher zijn ook vertegenwoordigd.
